El Halichoeres marginatus habita desde el Mar Rojo hasta Mozambique, las Hawaii, las Tuamotu, el sur del Japón y el sur de la Gran Barrera de Coral.

Es una especie que se adaptan bien a la vida en cautividad, resisten a las infecciones parasitarias y enfermedades. Tiene gran valor comercial por sus aptitudes como controlador biológico de plagas en los corales sésiles, en especial con los huevos de nudibranquios, gusanos de fuego y caracoles parasitarios del genero Pyramidellidae.